Năm 2020 trước đại dịch Covid, Trường Đại học Nguyễn Tất Thành đã nhanh chóng chuyển đổi sang hình thức đào tạo trực tuyến để đảm bảo không gián đoạn việc học tập của sinh viên. Cũng trong thời gian này, Nhà trường đã nộp Dự án và được Tổ chức Đại học Pháp ngữ tài trợ cho Trường thực hiện “Xây dựng Hệ thống đào tạo trực tuyến được thực hiện theo chuẩn mực quốc tế”. Sau 6 tháng thực hiện (từ tháng 11/2020 đến tháng 4/2021), Nhà trường đã triển khai thành công, đạt được tất cả các mục tiêu của Dự án.

Trước diễn biến phức tạp của đại dịch Covid – 19, Trường ĐH Nguyễn Tất Thành đã quyết định chuyển đổi thời gian thi và hình thức thi tập trung sang hình thức nộp bài thi và kết hợp phỏng vấn đối với môn năng khiếu.